Счётная палата проверила, как «Метрострой» и «Интарсия» использовали деньги из федерального бюджета. Установленная сумма ущерба при строительстве Мариинского театра и реставрации Главного штаба составляет десятки миллионов рублей. 

По Мариинке-2 нашли сразу несколько нарушений, но информацию пока опубликовали только об одном. Аудиторы выяснили, что оборудование стоило на 19,1 миллиона рублей дешевле, чем заявлял «Метрострой» в документах. Кроме того, компания нарушала и Бюджетный кодекс Санкт-Петербурга. Когда в 2009 году город купил 60 000 акций компании (а это 21 % уставного капитала) больше чем за 400 миллионов рублей, «Метрострой» обязан был разрешить городу участвовать в управлении. С тех пор договор так и не заключили, и теперь Счётная палата предлагает вернуть в федеральную собственность 21 % акций «Метростроя» — сейчас они стоят около 650 миллионов рублей.